承接第一季。三云修与空闲游真所在的玉狛第二,在B级排位战中不断晋级,目标是冲击A级。然而,来自近界外(邻国)的新威胁——“嘉洛普拉”远征军秘密潜入玄界,他们的目标是捕获拥有“黑触发器”能力的少年游真。与以往排位战完全不同,这是毫无规则的死斗。嘉洛普拉小队全员都是身经百战的杀手,他们不会遵守边境的“一对一”礼仪,而是采用偷袭、人质、信息战等恶劣手段。玉狛支部被迫进入紧急状态,修斯正式加入玉狛第二,三云修作为战术家的天赋首次被激发到极致。他以微弱的运算能力和对队友的绝对了解,设计出一套“诱导分断歼灭战”方案,用B级实力对抗A级以上的入侵者。真正的战争,从来不看排位。

第二季彻底封神!摒弃了第一季的拖沓节奏,全程高能无尿点。战术描写的精细程度在少年漫中独一档,每一场战斗都像围棋对弈。修斯加入后的四人小队化学反应爆炸,最后一集“修指挥作战”的分镜演出堪称教科书。